Бактероиды и родственные виды: ключевые таксоны микробиоты кишечника человека

Микробные сообщества играют важную роль в поддержании гомеостаза экосистем. В желудочно-кишечном тракте человека есть важные таксономические группы, однако ни один отдельный вид не выполняет роль ключевого таксона. Известно, что бактероиды играют важную роль в поддержании эубиоза кишечника. В этом обзоре рассмотрены их роль в кишечнике человека, потенциальная патогенность вне кишечника и способы адаптации к окружающей среде; особое внимание уделено данным о B. fragilis и B. thetaiotaomicron. Бактероиды — анаэробные неспорообразующие грамотрицательные микроорганизмы, устойчивые к желчным кислотам. Обычно они хорошо приспособлены к жизни в кишечнике и находятся в благоприятных для хозяина отношениях с организмом. Хотя бактероиды, как правило, являются комменсалами, некоторые виды при заболеваниях желудочно-кишечного тракта, травмах, онкологических заболеваниях или операциях на органах желудочно-кишечного тракта могут становиться оппортунистическими патогенами и вызывать инфекции, чаще всего внутрибрюшные. B. fragilis может приобретать устойчивость к противомикробным препаратам посредством нескольких механизмов, во многом благодаря пластичности и изменчивости генома. Бактероидоты (Bacteroidota; ранее Bacteroidetes) обладают широкими метаболическими возможностями в микробиоте желудочно-кишечного тракта и способны быстро адаптировать углеводный обмен к доступным питательным веществам. Бактероидоты кишечника образуют в качестве основных конечных продуктов короткоцепочечные жирные кислоты, такие как сукцинат, ацетат и бутират, а иногда и пропионат. Эти вещества оказывают разнообразное благоприятное воздействие на организм хозяина. Благодаря метаболизму желчных кислот бактероидоты также способствуют колонизационной резистентности к другим микроорганизмам, включая Clostridioides difficile, и поддержанию целостности кишечника.