Оценка современной эффективной численности популяции (N_e) методом неравновесия по сцеплению с использованием высокополиморфных генетических маркеров: практически неиспользованный ресурс для прикладной охраны природы и эволюционных исследований

Генетические методы широко применяются для оценки современной эффективной численности популяций (N_e) в природе, однако в подавляющем большинстве исследований использовался только временной, или двухвыборочный, метод. Мы использовали моделированные данные, чтобы оценить, как высокополиморфные молекулярные маркеры влияют на точность и смещение оценок при одно выборочном методе, основанном на неравновесии по сцеплению. Получены следующие результаты: (1) низкочастотные аллели приводят к завышению оценок N_e, однако простое правило позволяет снизить смещение до уровня менее примерно 10 %, практически не жертвуя точностью; (2) при использовании наборов данных, которые обычно доступны в настоящее время (10–20 локусов с 10 аллелями и 50 особей), можно получать точные оценки для относительно небольших популяций (N_e < 200), причём небольшие популяции вряд ли будут ошибочно приняты за крупные. Однако для крупных популяций надёжные оценки получить очень трудно; (3) при использовании данных по микросателлитам метод неравновесия по сцеплению обеспечивает более высокую точность, чем временной метод, если только выборки для последнего не были взяты с интервалом в много поколений. Наши результаты свидетельствуют о широких возможностях применения метода неравновесия по сцеплению в природоохранной деятельности, которая обычно сосредоточена на небольших популяциях, а также при изучении эволюционных процессов в локальных популяциях. Более широкое использование одно выборочных оценивателей и объединение оценок, полученных разными методами, позволяют существенно увеличить объём информации об эффективной численности популяций в природе.