Одноклеточный анализ выявляет новую эволюционную сложность увеальной меланомы

Увеальная меланома (УМ) — высокометастатическое злокачественное новообразование, которое, в отличие от кожной меланомы, практически не отвечает на иммунотерапию ингибиторами иммунных контрольных точек. С помощью одноклеточного секвенирования РНК (scRNA-seq) исследовали микроокружение опухоли на уровне отдельных клеток, проанализировав 59 915 опухолевых и неопухолевых клеток из 8 первичных и 3 метастатических образцов. В опухолевых клетках выявлены ранее не описанные субклональная геномная сложность и транскрипционные состояния. Иммунные клетки, инфильтрирующие опухоль, представлены ранее не распознанным разнообразием клеточных типов, включая CD8+ Т-клетки, преимущественно экспрессирующие маркер иммунной контрольной точки LAG3, а не PD1 или CTLA4. V(D)J-анализ выявил клонально расширенные Т-клетки, что указывает на их способность формировать иммунный ответ. Вялотекущий метастаз в печени при УМ класса 1B был инфильтрирован клонально расширенными плазматическими клетками, что свидетельствует об антитело-опосредованном иммунном ответе. Эта сложная экосистема опухолевых и иммунных клеток позволяет глубже понять биологию УМ; LAG3 может быть потенциальной мишенью для блокады иммунных контрольных точек у пациентов с УМ высокого риска.