Структурное и вычислительное исследование комплекса GroEL с прионным белком

Молекулярный шаперон GroEL способствует правильному сворачиванию белков и препятствует их агрегации. Однако взаимодействие GroEL с прионным белком PrP может приводить к патогенному превращению последнего в склонную к агрегации форму PrP. Молекулярные основы взаимодействия в комплексе GroEL–PrP исследовали с помощью криоэлектронной микроскопии и моделирования молекулярной динамики. Полученная структура по данным криоэлектронной микроскопии показывает, что PrP связывается с несколькими субъединицами GroEL в области их апикальных доменов. Согласно результатам моделирования молекулярной динамики, неупорядоченный N-концевой домен PrP образует с GroEL значительно больше межмолекулярных контактов. При связывании с GroEL в N-концевом домене PrP начинают формироваться короткие спирали, тогда как C-концевой домен PrP проявляет тенденцию к разворачиванию α2-спирали. В отсутствие нуклеотидов в системе эти процессы развиваются в диапазоне от сотен наносекунд до микросекунд.