Вариант SARS-CoV-2 Омикрон демонстрирует менее эффективную репликацию и фузионную активность по сравнению с вариантом Дельта в клетках, экспрессирующих TMPRSS2

Новый вариант SARS-CoV-2 Омикрон (B.1.1.529), впервые выявленный в начале ноября 2021 года, вызвал серьезную обеспокоенность во всем мире и содержит более 50 мутаций, многие из которых, как известно, влияют на трансмиссивность или обеспечивают ускользание от иммунного ответа. В этом исследовании мы стремились изучить вирусологические характеристики варианта Омикрон и сравнить его с вариантом Дельта, который доминировал в мире с середины 2021 года. В клетках VeroE6 с гиперэкспрессией трансмембранной сериновой протеазы 2 (VeroE6/TMPRSS2) вариант Омикрон реплицировался медленнее, чем вариант Дельта. Примечательно, что вариант Дельта хорошо реплицировался в клеточной линии Calu3, характеризующейся выраженной экспрессией TMPRSS2, тогда как вариант Омикрон в этой клеточной линии реплицировался плохо. В конкурирующем опыте вариант Дельта вытеснял вариант Омикрон в клетках VeroE6/TMPRSS2 и Calu3. Чтобы подтвердить различие путей проникновения между вариантами Омикрон и Дельта, мы оценили противовирусный эффект бafilомицина A1, хлорохина, ингибирующих эндоцитарный путь, и камостата, ингибирующего путь через TMPRSS2. Камостат резко подавлял вариант Дельта, но не вариант Омикрон, тогда как бafilомицин A1 и хлорохин подавляли оба варианта, Омикрон и Дельта. Кроме того, вариант Омикрон также демонстрировал более слабую клеточно-клеточную фузионную активность по сравнению с вариантом Дельта в клетках VeroE6/TMPRSS2. В совокупности наши результаты показывают, что инфекция вариантом Омикрон не усиливается за счет TMPRSS2, а в значительной степени опосредуется эндоцитарным путем. Различие путей проникновения между вариантами Омикрон и Дельта может иметь значение для клинических проявлений или тяжести заболевания.