Член семейства голгинов A7 типа B (GOLGA7B) — вероятный новый ген, связывающий рацион с высоким гликемическим индексом и угревую болезнь

Сигнальный путь IGF1/FoxO1/mTORC1 — хорошо изученное нутригеномное звено, связывающее рацион с высоким гликемическим индексом (ГИ) или высокой гликемической нагрузкой (ГН) с угревой болезнью. Однако другие сигнальные пути, участвующие в этой связи, пока не установлены. Мы изучили другие гены, которые могут быть связаны с рационом с высоким ГИ/ГН и угревой болезнью, используя эпидемиологические, геномные и транскриптомные данные участников из Сингапура и Малайзии. Привычки питания 3207 пациентов с акне (из них 1869 и 1341 дополнительно классифицировали соответственно по тяжести заболевания и степени рубцевания) и 2521 участника контрольной группы оценивали с помощью шкалы качества рациона с учётом гликемического индекса (QDGIS). По данным полногеномного секвенирования транскриптома мононуклеарных клеток периферической крови подгруппы участников выявили совпадающие по направлению изменения экспрессии генов, которые различались между пациентами с акне и контрольной группой, а также между группами с низким/умеренным и хорошим показателями QDGIS. Затем оценили связь однонуклеотидных полиморфизмов этих генов с уровнем их экспрессии (eQTL). Ежедневное употребление фруктов было связано со статистически значимым снижением риска развития акне, более тяжёлого течения и рубцевания — до 48,5%. У участников с хорошим показателем QDGIS риск лёгкого и среднетяжёлого/тяжёлого акне, а также рубцевания 1-й и 2-й степени был статистически значимо ниже. Последовательная фильтрация позволила выявить четыре совпадающих по направлению изменения экспрессии гена, статистически значимо связанных с акне и QDGIS: GOLGA7B, SNCB, LOC102723849 и LOC283683. Объединив данные транскриптомного и генетического анализа, мы выявили интронный однонуклеотидный полиморфизм rs1953947 в GOLGA7B, связанный с уровнем экспрессии гена при акне. Таким образом, GOLGA7B может быть новым геном, связывающим высокий ГИ/ГН с акне. Мы также предложили модель участия Golga7b в патогенезе акне, связанного с рационом с высоким ГИ/ГН, с участием пальмитоилтрансферазы zDHHC5, транслоказы жирных кислот CD36 и пальмитиновой кислоты.