Объединение данных менделевской рандомизации и колокализации: обзор и сравнение подходов

Менделевская рандомизация и колокализация — два статистических подхода, которые можно применять к суммарным данным полногеномных ассоциативных исследований (GWAS) для изучения взаимосвязей между признаками и заболеваниями. Однако, несмотря на сходство по области применения, эти подходы различаются целями, методами реализации и интерпретацией, отчасти потому, что были разработаны для разных научных сообществ. Менделевская рандомизация оценивает, связаны ли генетические предикторы экспозиции с исходом, и интерпретирует такую связь как свидетельство причинного влияния экспозиции на исход, тогда как колокализация оценивает, обусловлены ли два признака одними и теми же или разными причинными вариантами. При изучении генетических вариантов в одном геномном регионе можно применять оба подхода. Положительный результат колокализации обычно подразумевает ненулевую оценку эффекта в менделевской рандомизации, однако обратное, как правило, неверно: существуют ситуации, при которых получают ненулевую оценку в менделевской рандомизации, но отсутствуют доказательства колокализации. К ним относятся наличие разных, но коррелирующих причинных вариантов, связанных с экспозицией и исходом, что нарушает допущения менделевской рандомизации, а также отсутствие сильных ассоциаций с исходом. Поскольку колокализация была разработана в рамках традиции GWAS, наличие колокализации обычно признают только при убедительных доказательствах ассоциаций с обоими признаками. Напротив, ненулевую оценку в менделевской рандомизации можно получить даже при наличии лишь номинально значимых генетических ассоциаций с исходом в данном локусе. В этом обзоре обсуждается, как два подхода могут дополнять друг друга при оценке потенциальных терапевтических мишеней.