Новый мультиплексный LAMP-анализ для выявления респираторных аденовирусов человека

Аденовирусы человека (HAdV) — распространённые возбудители различных заболеваний, включая инфекции дыхательных путей. При отсутствии надёжных, быстрых и экономичных методов выявления HAdV пациенты могут получать ошибочный диагноз и ненадлежащее лечение. Для решения этой проблемы разработан мультиплексный метод петлевой изотермической амплификации (LAMP) для выявления видов HAdV-B, HAdV-C и HAdV-E, вызывающих инфекции дыхательных путей. Метод основан на анализе кривых плавления ампликонов, для каждого вида HAdV характерна определённая температура плавления. Типирование HAdV не требуется: результаты LAMP можно визуально оценивать с помощью колориметрического анализа. Метод надёжно выявляет не менее 375 копий ДНК HAdV-B и HAdV-C и 750 копий ДНК HAdV-E в одной реакции менее чем за 35 минут при 60 °C. Разработанные праймеры не демонстрируют перекрёстной реактивности с другими респираторными патогенами человека in silico. При валидации на 331 образце назальных мазков, полученных от пациентов с инфекциями дыхательных путей, совпадение результатов с разработанным в лаборатории мультиплексным методом количественной полимеразной цепной реакции составило 90–94%. Согласованность количественного и визуального вариантов LAMP достигла 99%. Новый мультиплексный метод LAMP может служить альтернативой ПЦР в диагностических целях, сокращая затраты времени персонала и оборудования, а также применяться для диагностики в месте оказания медицинской помощи. Аденовирус человека B; аденовирус человека C; аденовирус человека E