Полиморфизмы генов CACNA1A, CACNA1C и CACNA1H у корейских детей с задержкой развития и интеллектуальной недостаточностью: акцент на коморбидной эпилепсии

Введение: Задержка развития и интеллектуальная недостаточность часто сопровождаются эпилепсией; всё больше данных указывает на роль вариантов генов потенциалзависимых кальциевых каналов в патогенезе этих состояний. Целью исследования было изучить связь полиморфизмов генов CACNA1A, CACNA1C и CACNA1H с задержкой развития, интеллектуальной недостаточностью и коморбидной эпилепсией у корейских детей. Методы: Ретроспективно проанализированы данные 141 ребёнка с задержкой развития и интеллектуальной недостаточностью, которым выполнили полное экзомное секвенирование и у которых не выявили патогенных моногенных вариантов. На основании оценок функциональной аннотации и данных предыдущих исследований отобрали девять однонуклеотидных полиморфизмов в генах CACNA1A, CACNA1C и CACNA1H. Данные о генотипах извлекали из файлов вариантов, полученных при полном экзомном секвенировании; частоты аллелей и генотипов сравнивали с контрольными данными для восточноазиатской популяции из базы gnomAD и Корейской базы эталонного генома (KRGDB). Выполняли анализ подгрупп с учётом коморбидной эпилепсии. Результаты: У пациентов с задержкой развития и интеллектуальной недостаточностью частота аллеля B варианта rs16023 была значительно выше, чем в обеих контрольных выборках; этот вариант также был связан с коморбидной эпилепсией. При анализе распределения генотипов генотип BB чаще встречался у пациентов с эпилепсией. Выводы: Вариант rs16023 может способствовать генетической предрасположенности к задержке развития, интеллектуальной недостаточности и эпилепсии у корейских детей, потенциально посредством регуляторных механизмов. Полученные данные подтверждают значимость генов кальциевых каналов при расстройствах нейроразвития и подчёркивают важность учёта функциональной аннотации при приоритизации вариантов.