Проспективная клиническая валидация таргетного длинночтения секвенирования для предимплантационного генетического тестирования α-талассемии

Введение: Предимплантационное генетическое тестирование при моногенных заболеваниях (PGT-M) позволяет предотвратить передачу тяжёлой α-талассемии, однако стандартные подходы по-прежнему ограничены необходимостью создавать семейно-специфические тесты для прямого выявления вариантов, зависимостью от дополнительных образцов членов семьи для построения гаплотипов и трудоёмкой многоэтапной работой на нескольких платформах. PGT-M для α-талассемии на основе таргетного длинночтения секвенирования (tlrPGT-α-thal) объединяет прямое выявление вариантов и анализ сцепления гаплотипов в одном тесте, но проспективная клиническая валидация ранее отсутствовала.

Методы: В проспективное клиническое исследование в центре репродуктивной медицины с августа 2024 по март 2025 года включили 103 семьи с высоким риском передачи α-талассемии. Всем семьям провели параллельный слепой анализ с использованием как стандартного PGT-M на основе секвенирования нового поколения (сравнительный метод), так и tlrPGT-α-thal.

Результаты: В первичном анализе согласованности tlrPGT-α-thal полностью совпал со стандартным PGT-M на основе секвенирования нового поколения (507/507, 100,0%; точный 95% ДИ 99,3–100,0). Прямое выявление вариантов удалось в 501/507 эмбрионов (98,82%; 95% ДИ 97,4–99,6), сцепление гаплотипов было установлено в 505/507 эмбрионов (99,61%; 95% ДИ 98,6–100,0), а также был выявлен один случай мейотической рекомбинации. Среди 93 семей, дошедших до переноса эмбрионов, у 57 беременностей выполнена инвазивная пренатальная диагностика, и все результаты совпали с соответствующими данными tlrPGT-α-thal. Из 26 эмбрионов, по которым сравнительный метод не позволил сделать заключение, tlrPGT-α-thal разрешил 6 сложных случаев, включая случаи с неполными родословными или недостаточным числом информативных SNP. Среди оставшихся 20 эмбрионов с анеуплоидиями в области HBA генотип и родительское происхождение удалось определить у 12.

Выводы: Результаты показывают, что tlrPGT-α-thal позволяет в одном рабочем процессе напрямую выявлять разные варианты, вызывающие α-талассемию, и эффективно анализировать сцепление гаплотипов, не требуя семейно-специфического дизайна теста или дополнительных образцов членов семьи. Метод продемонстрировал высокую диагностическую точность и дал дополнительную информацию в сложных ситуациях. В целом tlrPGT-α-thal представляет собой упрощённую и широко применимую стратегию PGT-M при α-талассемии.