Генотип при врождённых ошибках иммунитета: ретроспективное исследование в Объединённых Арабских Эмиратах

Врождённые ошибки иммунитета существенно повышают бремя заболеваемости на Ближнем Востоке и в Северной Африке, особенно в Объединённых Арабских Эмиратах, где высокая частота кровнородственных браков способствует распространённости аутосомно-рецессивных и сложных генетических заболеваний. Региональные геномные данные о врождённых ошибках иммунитета остаются ограниченными, а популяционно-специфические варианты недостаточно представлены в глобальных базах данных, что снижает точность диагностики и препятствует внедрению прецизионной медицины. Мы ретроспективно проанализировали данные 2500 пациентов, которым за 10 лет в двух центрах третичной медицинской помощи в городе Аль-Айн (Объединённые Арабские Эмираты) были присвоены коды МКБ, связанные с иммунодефицитом. В анализ включили 232 пациентов (около 9%), для которых были доступны отчёты о генетическом тестировании врождённых ошибок иммунитета. Варианты аннотировали в соответствии с рекомендациями Американской коллегии медицинской генетики и геномики, а также с использованием открытых ресурсов, включая Ensembl и ClinVar; гены классифицировали по системе Международного союза иммунологических обществ. Частоты аллелей определяли на основании данных gnomAD и Emirati Genome Project. При наличии возможности сообщённые варианты систематически реклассифицировали с использованием Franklin, VarSome, ClinGen и HGMD. Согласно исходным отчётам, выявлено 245 случаев обнаружения вариантов, связанных с врождёнными ошибками иммунитета, в 107 генах: 99 (40,4%) патогенных или вероятно патогенных вариантов, 68 (27,8%) доброкачественных или вероятно доброкачественных вариантов и 78 (31,8%) вариантов неопределённого значения. После реклассификации доля патогенных и вероятно патогенных вариантов увеличилась до 107 (43,7%), доля вариантов неопределённого значения снизилась до 54 (22,0%), а доля доброкачественных и вероятно доброкачественных вариантов увеличилась до 76 (31,0%). Наиболее часто встречались варианты в генах ATM, DOCK8, RAG1, RAG2, UNC13D, LRBA, MEFV и NLRP3; 7,8% пациентов имели несколько вариантов, связанных с врождёнными ошибками иммунитета. Это одно из крупнейших геномных исследований врождённых ошибок иммунитета в Объединённых Арабских Эмиратах, показывающее, что систематическая переоценка вариантов повышает точность диагностики и подчёркивающее значение популяционно-специфических геномных ресурсов для прецизионной медицины.