Гены, чувствительные к PGC-1α и участвующие в окислительном фосфорилировании, координированно сниженно экспрессируются при сахарном диабете у человека

ДНК-микрочипы можно использовать для выявления изменений экспрессии генов, характерных для заболеваний человека. Однако это трудно, когда значимые различия на уровне отдельных генов невелики. Мы предлагаем аналитический подход — анализ обогащения наборов генов, предназначенный для выявления умеренных, но согласованных изменений экспрессии групп функционально связанных генов. С помощью этого подхода мы выявили набор генов, участвующих в окислительном фосфорилировании, экспрессия которых координированно снижена в скелетной мышце у больных сахарным диабетом. Экспрессия этих генов высока в участках инсулин-опосредованного утилизации глюкозы, активируется PGC-1α и коррелирует с общей аэробной работоспособностью организма. Наши результаты связывают этот набор генов с клинически значимой вариабельностью метаболизма у человека и демонстрируют ценность анализа путей в исследованиях геномного профилирования.