Некодирующая РНК: какие РНК выполняют функции, а какие являются генетическим мусором?

Геномы крупных многоклеточных эукариот преимущественно состоят из ДНК, не кодирующей белки. Хотя большинство исследователей согласны с тем, что небольшая часть этих геномов выполняет важные биологические функции, вопрос о том, вносит ли остальная ДНК вклад в развитие и/или поддержание гомеостаза, остаётся предметом дискуссий. Значительная часть предположений связана с геномными участками, которые транскрибируются на низком уровне. К сожалению, этим РНК произвольно присваивали различные названия, например «межгенные РНК» и «длинные некодирующие РНК», что привело к определённой путанице в данной области. Многие исследователи считают, что эти транскрипты представляют собой огромный, ещё не изученный мир функциональных некодирующих РНК, лишь на том основании, что они существуют. Однако есть основания сомневаться в столь оптимистичном представлении, поскольку оно не учитывает современные представления о том, как эволюция формирует геномы эукариот и как работает аппарат экспрессии генов в эукариотических клетках. Хотя, безусловно, предстоит обнаружить и охарактеризовать ещё множество функциональных некодирующих РНК, вероятно, многие из этих транскриптов являются генетическим мусором. В статье обсуждаются подходы к определению функции конкретной некодирующей РНК. Принципиально важно, что при отсутствии соответствующих данных нулевой гипотезой должно быть отсутствие у исследуемой РНК функционального значения.