Выявление нового коронавируса, вызывающего тяжёлую пневмонию у человека: описательное исследование
Identification of a novel coronavirus causing severe pneumonia in human: a descriptive study
Аннотация
Введение: Инфекции человека, вызванные зоонозными коронавирусами, включая коронавирус тяжёлого острого респираторного синдрома (SARS-CoV) и коронавирус ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV), вызывают серьёзную обеспокоенность во всём мире в связи с общественным здравоохранением. Здесь мы сообщаем о новом коронавирусе бат-происхождения, вызывающем тяжёлую и летальную пневмонию у человека.
Методы: Мы собрали клинические данные и образцы бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ) у пяти пациентов с тяжёлой пневмонией из больницы Цзиньиньтань города Ухань, провинция Хубэй, Китай. Нуклеиновые кислоты БАЛ экстрагировали и подвергали секвенированию нового поколения. Провели выделение вируса и построили филогенетические деревья методом максимального правдоподобия.
Результаты: У пяти пациентов, госпитализированных с 18 по 29 декабря 2019 года, отмечались лихорадка, кашель и одышка, сопровождавшиеся осложнениями в виде острого респираторного дистресс-синдрома. При рентгенографии грудной клетки выявлялись диффузные затемнения и консолидация. Один из этих пациентов умер. Результаты секвенирования выявили присутствие ранее неизвестного штамма β-коронавируса у всех пяти пациентов; нуклеотидная идентичность изолятов составляла от 99,8% до 99,9%. Эти изоляты имели 79,0% нуклеотидной идентичности с последовательностью SARS-CoV (GenBank NC_004718) и 51,8% — с последовательностью MERS-CoV (GenBank NC_019843). Филогенетически вирус наиболее близок к SARS-подобному коронавирусу летучих мышей (SL-ZC45, GenBank MG772933) с 87,6–87,7% нуклеотидной идентичности, но образует отдельную кладу. Кроме того, у этих вирусов имеется единственная интактная открытая рамка считывания гена 8, что дополнительно указывает на их происхождение от коронавирусов летучих мышей. Однако аминокислотная последовательность предполагаемого рецептор-связывающего домена сходна с таковой у SARS-CoV, что указывает на возможное использование ими того же рецептора.
Выводы: Выявлен новый коронавирус, переносимый летучими мышами, ассоциированный с тяжёлым и летальным респираторным заболеванием у человека.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.