Транскриптомные характеристики жидкости бронхоальвеолярного лаважа и мононуклеарных клеток периферической крови у пациентов с COVID-19

Текущая вспышка COVID-19, циркулирующая в Китае и 158 других странах и регионах, привела к высокой смертности и представляет серьезную угрозу для общественного здравоохранения. Однако усилия по поиску эффективных поддерживающих лекарственных средств и методов лечения затруднены из-за ограниченного понимания иммунного ответа хозяина при этом смертельном заболевании. Чтобы охарактеризовать транскрипционные сигнатуры воспалительного ответа хозяина на инфекцию SARS-CoV-2 (HCoV-19), мы провели секвенирование транскриптома РНК, выделенной из образцов жидкости бронхоальвеолярного лаважа (ЖБАЛ) и мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК) пациентов с COVID-19. Наши результаты выявляют различающиеся профили воспалительных цитокинов хозяина при инфекции SARS-CoV-2 у пациентов и подчеркивают связь между патогенезом COVID-19 и избыточной секрецией цитокинов, таких как CCL2/MCP-1, CXCL10/IP-10, CCL3/MIP-1A и CCL4/MIP1B. Кроме того, индуцированная SARS-CoV-2 активация апоптоза и сигнального пути p53 в лимфоцитах может быть причиной лимфопении у пациентов. Данные транскриптома пациентов с COVID-19 могут стать ценным ресурсом для клинических рекомендаций по противовоспалительной терапии и понимания молекулярных механизмов ответа хозяина.