Интеграция многомодальных омиксных данных: обзор концепций, соображений и подходов

Применение омиксных технологий, включая, но не ограничиваясь геномикой/метагеномикой, транскриптомикой/метатранскриптомикой, протеомикой/метапротеомикой и метаболомикой, для получения нескольких наборов данных из одного образца облегчило выдвижение гипотез и позволило выявлять биологические, молекулярные и экологические функции и механизмы, а также ассоциации и корреляции. Несмотря на их мощь и перспективность, при успешном планировании и выполнении мультимоиксного исследования необходимо учитывать целый ряд проблем. В этом обзоре описаны различные омиксные технологии, применимые к одиночным организмам и метаорганизмам (то есть хозяин + микробиом), а также обсуждаются особенности забора, хранения и обработки образцов до получения и анализа данных, равно как и подходы к их хранению, распространению и анализу. Наконец, приведены клинические примеры применения мультимоиксного подхода, позволяющие получить новые сведения и более целостное понимание биологических процессов.