Инструментарий для количественной оценки биологического возраста по данным биохимического анализа крови и функциональных исследований органов: BioAge

Методы количественной оценки биологического старения становятся новыми инструментами измерения в эпидемиологии и популяционной науке; в клинических исследованиях в области геронауки их предлагают использовать в качестве суррогатных показателей увеличения продолжительности здоровой жизни. Общедоступные программные пакеты для расчёта показателей биологического старения по данным метилирования ДНК ускорили распространение этих методов и позволили быстро накопить знания о характеристиках различных показателей в разных наборах данных. Показатели биологического возраста, получаемые по данным биохимического анализа крови, были разработаны одновременно с показателями на основе метилирования ДНК и в нескольких исследованиях продемонстрировали более высокую эффективность при прогнозировании продолжительности здоровой жизни. Однако их распространение шло значительно медленнее, что привело к существенному пробелу в знаниях. Для его восполнения мы разработали программный пакет. Пакет BioAge для R, доступный для загрузки на GitHub (http://github.com/dayoonkwon/BioAge), реализует три опубликованных метода количественной оценки биологического старения на основе анализа хронологического возраста и риска смерти: биологический возраст по методу Klemera–Doubal, PhenoAge и гомеостатическую дисрегуляцию. Пакет позволяет настраивать алгоритмы расчёта показателей с использованием пользовательских наборов биомаркеров, сравнивать полученные показатели с опубликованными версиями алгоритмов метода Klemera–Doubal и PhenoAge, а также рассчитывать показатели в новых наборах данных. Мы применили BioAge к данным лабораторных исследований безопасности из рандомизированного контролируемого исследования CALERIE™, первого в истории исследования длительного ограничения калорийности у здоровых взрослых без ожирения, чтобы оценить влияние вмешательства на биологическое старение. Полученные результаты свидетельствуют о том, что вмешательство в исследовании CALERIE замедляло биологическое старение. BioAge — это инструментарий, предназначенный для облегчения измерения биологического возраста в геронауке.