Полигенный показатель риска миомы матки связан с заболеванием и позволяет прогнозировать вероятность его развития

Миома матки — распространённая опухоль малого таза у женщин с наследственной предрасположенностью. В исследованиях полногеномных ассоциаций (GWAS) выявлено около 30 локусов, связанных с повышенным риском миомы матки. На основе сводных статистических данных ранее опубликованного GWAS миомы матки, проведённого среди женщин неиспаноязычного европейского происхождения (NHW) из сети Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE), был разработан полигенный показатель риска (PRS). Показатель риска миомы матки разработали с помощью PRSice и оптимизировали в отдельной клинической популяции BioVU. Его валидировали с использованием логистической регрессии с 10-кратной перекрёстной проверкой и исследования ассоциаций с феномом (PheWAS) в отдельной выборке женщин NHW из eMERGE; образцы, включённые в GWAS, исключили. По результатам анализа PRSice отобрали варианты с p < 0,001; после прореживания с учётом неравновесия по сцеплению (r < 0,2) в показатель вошли 4458 вариантов. Показатель был статистически значимым (псевдо-R = 0,0018; p = 0,041). При логистической регрессии с 10-кратной перекрёстной проверкой валидационной выборки площадь под ROC-кривой составила 0,60 (95% доверительный интервал 0,58–0,62). В ходе PheWAS выявили шесть фенотипических кодов, связанных с показателем; наиболее значимыми были 218 «доброкачественное новообразование матки» и 218.1 «лейомиома матки» (p = 1,94 × 10; отношение шансов 1,31 [95% доверительный интервал 1,26–1,37] и p = 3,50 × 10; отношение шансов 1,32 [95% доверительный интервал 1,26–1,37]). Разработан и валидирован первый полигенный показатель риска миомы матки. Он обладает прогностической способностью и отражает генетическую основу повышенного риска миомы матки, что может быть использовано в дальнейших исследованиях.