Обзор применения глубокого обучения в геномике человека с использованием данных секвенирования нового поколения

Геномика развивается в сторону науки, основанной на данных. С появлением высокопроизводительных технологий генерации данных в геномике человека мы оказались перед массивом геномных данных. Для извлечения знаний и выявления закономерностей из этих данных существенную роль сыграл искусственный интеллект, особенно методы глубокого обучения. В настоящем обзоре рассматриваются разработка и применение методов и моделей глубокого обучения в различных разделах геномики человека. Мы оценили области геномики, которые с помощью методов глубокого обучения были изучены недостаточно или, напротив, чрезмерно подробно. В последней части обзора кратко обсуждаются алгоритмы глубокого обучения, лежащие в основе геномных инструментов. Наконец, кратко рассмотрено недавнее применение инструментов глубокого обучения в геномике. В целом этот обзор своевременен для специалистов в области биотехнологии и геномики и должен помочь им понять, почему, когда и как использовать методы глубокого обучения для анализа геномных данных человека.