Leuconostoc aquikimchii sp. nov. — новый вид молочнокислой бактерии, выделенной из водяного кимчи из капусты

Из водяного кимчи из капусты, приготовленного в Республике Корея, выделили два грамположительных, факультативно-анаэробных, негемолитических штамма бактерий кокковидной формы — MS01 и MS02. Рост клеток наблюдался при температуре 5–25 °C (оптимум — 20 °C), pH 5–8 (оптимум — pH 7) и концентрации NaCl 0–5% (масс./об.) (оптимум — 1%). Филогенетический анализ последовательностей гена 16S рРНК показал, что последовательности штаммов MS01 и MS02 идентичны; в филогенетических деревьях они образовывали кластер в пределах клады Leuconostoc и были наиболее близки к Leuconostoc inhae IH003 и Leuconostoc gasicomitatum LMG 18811 (сходство последовательностей — 98,74%). Полные последовательности геномов штаммов MS01 и MS02 имели размер 2,04–2,06 млн пар нуклеотидов и включали плазмиду размером 50,6 кб; содержание Г+Ц в ДНК обоих штаммов составляло 37,7%. По показателям средней нуклеотидной идентичности (ANI) и цифровой ДНК-ДНК-гибридизации (dDDH) подтверждено, что оба штамма относятся к одному виду, однако их показатели по сравнению с другими видами Leuconostoc составляли не более 85,9% и 29,9% соответственно, что указывает на принадлежность к новому виду. Реконструкция метаболических путей показала, что оба штамма осуществляют гетероферментативное молочнокислое брожение с образованием лактата, ацетата и этанола. Хемотаксономический анализ, включавший исследование клеточных жирных кислот, полярных липидов и аминокислотного состава пептидогликана, подтвердил принадлежность обоих штаммов к роду Leuconostoc. На основании филогенетических, геномных и фенотипических характеристик штаммы MS01 и MS02 отнесены к новому виду рода Leuconostoc, для которого предложено название Leuconostoc aquikimchii sp. nov.; типовой штамм — MS01 (= KACC 23748 = JCM 37028).