Неинвазивный скрининг патогенных микродисбалансов плода на основе секвенирования единичных клеток крови матери: сравнение с инвазивной пренатальной диагностикой

Цель: Патогенные или вероятно патогенные варианты числа копий (п/впCNV) являются значимой причиной перинатальной заболеваемости и смертности. Современный пренатальный скрининг на основе внеклеточной ДНК (вкДНК) не позволяет выявить большинство микродисбалансов (микроделеций и микродупликаций), что оставляет существенный остаточный риск недиагностированных хромосомных аномалий. В данном исследовании оценивалась клиническая эффективность нового метода неинвазивного пренатального тестирования на основе секвенирования единичных клеток (scsbNIPT) с использованием циркулирующих вневорсинчатых трофобластов (cEVT) для выявления CNV плода, в частности микродисбалансов размером менее 8 Мб.

Методы: Проведено проспективное слепое обсервационное многоцентровое когортное исследование с участием 1390 беременных женщин группы высокого риска, проходивших инвазивную пренатальную диагностику в период с ноября 2021 по декабрь 2023 года. Образцы материнской крови объемом 20 мл забирали у каждой участницы на сроке от 11 + 0 до 22 + 6 недель беременности до проведения инвазивных процедур. Выделенные cEVT подвергались полногеномному секвенированию по запатентованному протоколу. Результаты scsbNIPT сравнивали с результатами стандартной инвазивной диагностики, полученными методом кариотипирования и/или хромосомного микроматричного анализа.

Результаты: scsbNIPT продемонстрировал чувствительность 92,9% (95% ДИ 76,5–99,1%) и специфичность 98,2% (95% ДИ 97,0–99,0%) в отношении выявления полногеномных микродисбалансов размером от 300 кб до 8 Мб. Чувствительность для п/впCNV размером от 300 кб и более при скрининге на сроке 11 + 0 – 14 + 6 недель составила 100% (95% ДИ 83,9–100%). Для трисомии по 21-й хромосоме чувствительность scsbNIPT составила 98,0% (95% ДИ 92,9–99,8%), а специфичность — 99,7% (95% ДИ 99,0–99,9%).

Выводы: Исследование подтверждает научную обоснованность и клиническую значимость scsbNIPT для неинвазивного выявления полногеномных CNV у плода. Метод обладает высокой чувствительностью и разрешающей способностью, сопоставимой с хромосомным микроматричным анализом. scsbNIPT обеспечивает более полный скрининг полногеномных CNV, значительно снижая остаточный риск на ранних сроках беременности по сравнению с существующими методами на основе вкДНК.