Транскриптомный анализ образцов, полученных методом скотч-теста, выявляет иммунные сигнатуры кожной Т-клеточной лимфомы, отличающиеся от таковых при доброкачественных воспалительных заболеваниях кожи
Tape-strip transcriptomics identify immune signatures in cutaneous T-cell lymphoma distinct from benign inflammatory skin diseases
Аннотация
Введение: Первичные кожные Т-клеточные лимфомы (КТКЛ), особенно на ранних стадиях, часто имеют клинические и гистопатологические признаки, сходные с таковыми при атопическом дерматите (АД) и псориазе. Это приводит к задержке диагностики и неэффективному или даже потенциально вредному лечению. Поэтому крайне необходимы малоинвазивные молекулярные тесты, позволяющие отличать КТКЛ от доброкачественных воспалительных дерматозов.
Цель: Определить, позволяет ли транскриптомный анализ образцов, полученных методом скотч-теста, выявлять специфичные для заболевания сигнатуры, отличающие раннюю стадию КТКЛ от АД, псориаза и кожи здоровых лиц.
Методы: Выполнено секвенирование суммарной РНК в образцах поражённой и непоражённой кожи, полученных методом скотч-теста, у пациентов с грибовидным микозом (ГМ; n=18), АД (n=36), псориазом (n=32) и у здоровых лиц (n=30).
Результаты: Анализ главных компонент выявил различное распределение образцов поражённой кожи при ГМ, АД и псориазе по сравнению с кожей здоровых лиц. Для ГМ был характерен смешанный иммунный профиль, в отличие от выраженной поляризации иммунного ответа по типу Th2 при АД и Th17/Th22 при псориазе. Гены, экспрессия которых повышалась при ГМ, участвовали в регуляции иммунных контрольных точек (CTLA4, ICOS), миграции лимфоцитов (CCR7, CCR8), презентации антигена (HLA-DRA, LAMP3), выживании Т-клеток (TNFSF13B, BIRC3), метаболизме (BCAT1, ENPP4, LIPA), а также поддержании клеточной структуры и гомеостаза (CLIC2, DOCK10, EPB41L3, MCOLN2, MS4A14, S100B). Выявлен классификатор на основе пяти генов-маркеров, включая IL36A, который точно отличал ГМ от АД и псориаза; результат подтверждён в независимом наборе данных.
Выводы: Метод скотч-теста позволяет выявлять специфичные для ГМ сигнатуры, отличающиеся от таковых при АД и псориазе, и потенциально может использоваться как диагностический инструмент для дифференциации ГМ и его доброкачественных клинических имитаторов.
Переведем эту статью за 1 час
Загрузите PDF, а мы сделаем полный перевод, краткий конспект и красивую инфографику.
Попробовать бесплатно →Также в Подтеме: еженедельные литобзоры, база международных клинреков и конспекты свежих мед. статей и подкастов каждый день.