Клиническая ценность метагеномного секвенирования нового поколения у детей с лихорадкой неясного генеза

Цель: Инфекционные заболевания являются наиболее частой причиной лихорадки неясного генеза (ЛНГ). Возможности традиционной микробиологической диагностики ограничены длительными сроками получения результатов, чувствительностью к влиянию факторов со стороны организма пациента и окружающей среды, низкой чувствительностью выявления и ограниченной способностью обнаруживать редких возбудителей. Метагеномное секвенирование нового поколения (mNGS) позволяет одновременно проводить широкоспектральный поиск микробных возбудителей. Целью исследования было оценить клиническую целесообразность применения mNGS у детей с ЛНГ и получить описательные наблюдательные данные о выявлении возбудителей и связанных по времени изменениях противоинфекционной терапии.

Методы: В ретроспективный одноцентровый анализ включили 41 госпитализированного ребёнка с диагнозом ЛНГ, которым выполняли исследование методом mNGS в отделении инфекционных заболеваний Детской больницы, аффилированной с Шаньдунским университетом, с июня 2022 года по июль 2025 года. На первом этапе всем пациентам проводили комплексное стандартное обследование. При сохранявшейся лихорадке на фоне отрицательных результатов традиционного обследования и высокой вероятности инфекционной этиологии либо при недостаточном ответе на эмпирическую противоинфекционную терапию дополнительно выполняли mNGS. Для исследования направляли только стерильные биологические жидкости. Каждый образец разделяли на две части: одну исследовали стандартными микробиологическими методами, включая посев, микроскопию мазка и ПЦР, а вторую замораживали для последующего анализа методом mNGS. Эффективность выявления возбудителей методом mNGS и стандартными методами сравнивали по парным образцам.

Результаты: Проанализированы 41 случай у детей; исследовали три типа образцов: кровь, спинномозговую жидкость и тканевую жидкость, включая глубокий гной, послеоперационное отделяемое, субдуральный выпот и аспират из объёмного образования. Методом mNGS выявлены 30 микробных изолятов у 20 пациентов, включая бактерии, вирусы, грибы и микоплазмы; 17 изолятов в итоге были подтверждены как этиологические возбудители. Статистически значимых различий по частоте положительных результатов между mNGS и стандартными методами при анализе парных таблиц сопряжённости 2 × 2 не выявлено (во всех случаях p > 0,05). После выявления возбудителей методом mNGS были зарегистрированы изменения противоинфекционной терапии: 4 пациентам дополнительно назначили противовирусные препараты, у 6 пациентов усилили антибактериальную терапию, у 2 пациентов её деэскалировали, а ещё у 5 пациентов полностью изменили схему лечения.

Выводы: В изученной целевой подгруппе детей с ЛНГ общая частота выявления возбудителей методом mNGS статистически не отличалась от таковой при стандартном микробиологическом исследовании. Поэтому в настоящее время mNGS не может заменить стандартный диагностический алгоритм или применяться для рутинного обследования всех детей с ЛНГ. Спектры выявляемых возбудителей у двух методов дополняют друг друга. mNGS может использоваться как вспомогательный метод при сложных инфекционных случаях с отрицательными результатами стандартных исследований. Исследование предоставляет описательные наблюдательные данные о выявлении возбудителей и связанных по времени изменениях противоинфекционной терапии в отобранной когорте детей с ЛНГ. Для подтверждения полученных результатов необходимы проспективные исследования с бо́льшим числом участников.