Род Lactobacillus: обновление таксономии

Молочнокислые бактерии представляют собой функциональную группу микроорганизмов, включающую грамположительные каталазонегативные бактерии, образующие молочную кислоту как основной конечный продукт метаболизма при ферментации углеводов. Среди молочнокислых бактерий род Lactobacillus включает множество видов, имеющих статус GRAS (общепризнанно безопасных), а многие его штаммы относятся к наиболее важным бактериям в пищевой микробиологии и питании человека благодаря их использованию в производстве ферментированных продуктов и в качестве пробиотиков. С таксономической точки зрения в состав рода Lactobacillus на момент проведения исследования (октябрь 2012 года) входили 152 валидно описанных вида. Род относится к семейству Lactobacillaceae вместе с родом Pediococcus, с которым он филогенетически перемешан. Обновлённый филогенетический анализ на основе последовательностей гена 16S рРНК показал, что семейство подразделяется на 15 групп, включающих по три и более вида, 4 пары видов и 10 самостоятельных филогенетических линий. Кроме того, были собраны другие таксономически значимые сведения о видах рода Lactobacillus. Цель исследования — обновить таксономию рода Lactobacillus, представить филогенетическую структуру семейства Lactobacillaceae и обсудить кластеры как возможные основы для родов, которые могут быть описаны в будущем. Ожидается, что приведённые сведения о правильной идентификации и номенклатуре полезных штаммов лактобацилл будут полезны учёным и производителям пробиотиков.