Состав кишечной микробиоты отражает тяжесть заболевания и дисфункциональные иммунные ответы у пациентов с COVID-19

Цель: Хотя COVID-19 прежде всего является респираторным заболеванием, накапливаются данные, указывающие на вовлечение желудочно-кишечного тракта. Мы изучили, связан ли кишечный микробиом с тяжестью заболевания у пациентов с COVID-19 и, если имеются нарушения состава микробиоты, нормализуются ли они после элиминации вируса SARS-CoV-2.

Методы: В когортном исследовании, проведённом в двух больницах, были получены кровь, кал и медицинская документация 100 пациентов с лабораторно подтверждённой инфекцией SARS-CoV-2. У 27 из 100 пациентов последовательные образцы кала собирали в течение 30 дней после элиминации SARS-CoV-2. Состав кишечного микробиома характеризовали методом дробового секвенирования общей ДНК, выделенной из кала. Концентрации воспалительных цитокинов и показатели крови измеряли в плазме.

Результаты: Состав кишечной микробиоты у пациентов с COVID-19 был значительно изменён по сравнению с лицами без COVID-19 независимо от того, получали ли пациенты медикаментозную терапию (p<0,01). У пациентов наблюдалось снижение представленности нескольких комменсалов кишечника с известным иммуномодулирующим потенциалом, таких как Faecalibacterium prausnitzii, Eubacterium rectale и бифидобактерии; их низкий уровень сохранялся в образцах, собранных вплоть до 30 дней после разрешения заболевания. Кроме того, выраженность этих нарушений коррелировала с тяжестью заболевания и сочеталась с повышением концентрации воспалительных цитокинов и таких показателей крови, как С-реактивный белок, лактатдегидрогеназа, аспартатаминотрансфераза и гамма-глутамилтрансфераза.

Вывод: Ассоциации между составом кишечной микробиоты, уровнем цитокинов и воспалительных маркеров у пациентов с COVID-19 указывают на вовлечение кишечного микробиома в определение выраженности COVID-19, возможно, через модуляцию иммунных ответов хозяина. Кроме того, дисбиоз кишечной микробиоты после разрешения заболевания может способствовать сохранению симптомов, что подчёркивает необходимость понять, как кишечные микроорганизмы участвуют в воспалении и COVID-19.