25 лет базы данных IPD-IMGT/HLA

Двадцать пять лет назад, в 1998 году, группа по информатике HLA Института исследований Энтони Нолана выпустила базу данных IMGT/HLA. С тех пор этот сетевой ресурс служит хранилищем многочисленных вариантов последовательностей аллелей HLA, названных Комитетом ВОЗ по номенклатуре факторов системы HLA. База данных IPD-IMGT/HLA обеспечивала стабильное, легко доступное и удобное для пользователя хранилище для этой работы. За это время технологии HLA-типирования существенно изменились. Секвенирование нового поколения (NGS) вытеснило прежние методы HLA-типирования и позволяет получать большие объёмы данных высокоразрешающего секвенирования. Это привело к резкому увеличению числа и сложности последовательностей, поступающих в базу данных. Задача базы данных IPD-IMGT/HLA заключалась в том, чтобы поддерживать высочайшие стандарты курирования, сохраняя при этом основной набор инструментов и функциональности для пользователей на фоне роста числа поступлений и последовательностей. Традиционные методы доступа к данным и их представления оказались недостаточными, и для того, чтобы идти в ногу со временем и поддерживать меняющийся состав пользователей, пришлось разработать новые методы с использованием новых вычислительных технологий.