Эпигенетическая безопасность созревания ооцитов in vitro при синдроме поликистозных яичников: профилирование метилирования ДНК в пуповинной крови в полногеномном масштабе по данным рандомизированного контролируемого исследования

Введение: Созревание ооцитов in vitro (IVM) является более безопасной альтернативой стандартному экстракорпоральному оплодотворению (ЭКО) у женщин с синдромом поликистозных яичников (СПКЯ), поскольку позволяет снизить риск синдрома гиперстимуляции яичников. Однако остаются опасения, не нарушает ли IVM эпигенетическое перепрограммирование у потомства. Имеющиеся данные ограничены исследованиями кандидатных генов или отсутствием контроля со стороны родителей. Целью исследования было оценить безопасность IVM в отношении полногеномного метилирования ДНК по сравнению со стандартным ЭКО с использованием строгого дизайна с триадами.

Методы: Это вторичный эпигенетический анализ, проведённый в рамках рандомизированного контролируемого исследования (ClinicalTrials.gov: NCT03463772). В исследование включили 10 нуклеарных семей (триад): пять детей, зачатых после IVM, и пять детей, зачатых после ЭКО, а также их биологических родителей. В обеих группах использовали единый подход с криоконсервацией и переносом одного бластоциста, чтобы свести к минимуму гормональные смешивающие факторы. Геномную ДНК из пуповинной крови и периферической крови родителей анализировали методом секвенирования с пониженным представительством после бисульфитной обработки (RRBS). Затем сравнивали паттерны метилирования по всему геному и дифференциально метилированные участки (DMR) между группами.

Результаты: Клинические характеристики в группах IVM и ЭКО были сопоставимы. Полногеномный анализ показал высокую согласованность паттернов метилирования в пуповинной крови: не выявлено значимых различий в общих уровнях метилирования CpG или в их распределении по основным геномным регионам (промоторам, CpG-островкам и телам генов). В пуповинной крови выявили лишь три редких DMR, что составило примерно 0,0001% генома; ни один из них не локализовался в импринтированных локусах или в участках, критически важных для развития. Кроме того, вариабельность метилирования в группах не различалась.

Выводы: Полученные данные предоставляют убедительные механистические доказательства эпигенетической безопасности IVM. Выраженная стабильность неонатального метилома подтверждает, что при данных условиях IVM не нарушает раннее программирование развития, что делает этот метод безопасной и жизнеспособной альтернативой для женщин с СПКЯ.