Генетическое тестирование при неврологических заболеваниях у детей

Цель: Оценить практику генетического тестирования (экзомное секвенирование, коммерческие панели и разработанные в учреждении панели генов) в крупном многопрофильном стационаре, выявить существующие пробелы и определить клинические признаки, ассоциированные с патогенными генетическими вариантами.

Методы: В ретроспективное когортное исследование включили пациентов младше 18 лет, наблюдавшихся в неврологическом отделении и направленных на генетическое тестирование по поводу неврологических заболеваний, эпилепсии и двигательных расстройств в 2020–2023 годах. Для выявления клинических признаков, предсказывающих положительный результат, использовали логистическую регрессию. Оценивали клиническую пользу генетического тестирования.

Результаты: Генетическое тестирование прошли 390 пациентов: 125 — методом экзомного секвенирования, 143 — с использованием коммерческой панели, 78 — панели генов эпилепсии, разработанной в учреждении, и 44 — панели генов двигательных расстройств, разработанной в учреждении. Наибольшая диагностическая выявляемость патогенных вариантов была получена при экзомном секвенировании (n = 49; 39%), далее следовали панели генов эпилепсии (n = 22; 28%), двигательных расстройств (n = 11; 25%) и коммерческие панели (n = 22; 15%). Варианты неопределённого клинического значения чаще всего выявляли при использовании коммерческих панелей (64%) и панелей генов эпилепсии (34%). В когорте экзомного секвенирования преобладали задержка развития (89%), интеллектуальная недостаточность (51%) и эпилепсия (35%). Патогенные варианты чаще выявляли у пациентов с тяжёлой задержкой развития (33%; p = 0,03) и гипотонией (39%; p = 0,05). Генетическое тестирование существенно помогало принимать клинические решения: это было отмечено в 49% случаев выявления патогенных вариантов в когорте экзомного секвенирования.

Выводы: Экзомное секвенирование превосходит панели генов по эффективности подтверждения генетического диагноза у детей с неврологическими заболеваниями и подчёркивает необходимость развития местной инфраструктуры диагностического генетического тестирования.