Диагностическая ценность экзомного секвенирования при пренатальной диагностике структурных аномалий плода: систематический обзор и метаанализ

Цель: Провести систематический обзор и метаанализ, чтобы определить диагностическую ценность экзомного секвенирования (ЭС) для пренатальной диагностики структурных аномалий плода, когда кариотип и/или хромосомный микроматричный анализ (ХМА) остаются нормальными.

Методы: После поиска в четырёх электронных базах данных в анализ включали исследования с участием не менее 10 плодов со структурными аномалиями, которым выполняли ЭС или полногеномное секвенирование. Рассчитывали дополнительную диагностическую ценность ЭС по сравнению с ХМА/кариотипом и объединяли данные в метаанализе. В подгрупповых анализах оценивали влияние отбора случаев и фенотипа плода на диагностическую ценность.

Результаты: Выявлено 72 сообщения из 66 исследований, включавших 4350 плодов. Суммарная дополнительная диагностическая ценность ЭС составила 31% (95% доверительный интервал 26-36%, p < 0,0001). Диагностическая ценность была значимо выше у случаев, предварительно отобранных по вероятности моногенной этиологии, по сравнению с неотобранными случаями (42% против 15%, p < 0,0001). Диагностическая ценность значимо различалась между фенотипическими подгруппами и варьировала от 53% (95% доверительный интервал 42-63%, p < 0,0001) при изолированных скелетных аномалиях до 2% (95% доверительный интервал 0-5%, p = 0,04) при изолированном увеличении толщины воротникового пространства.

Вывод: При структурных аномалиях плода, если кариотип и ХМА не позволяют установить диагноз, пренатальное ЭС обеспечивает дополнительную диагностику ещё у 31% случаев. Ожидаемая диагностическая ценность зависит от поражённых систем органов и может быть повышена предварительным отбором случаев после междисциплинарного обсуждения для оценки вероятности моногенной причины.