Связь между микробиотой кала человека и депрессией

Введение: Депрессия — хронический синдром, в патогенез которого вовлечены различные генетические, биологические и факторы окружающей среды. В моделях на животных уже установлены несколько связей между кишечной микробиотой и депрессией. Однако у человека такие корреляции показаны лишь в немногих работах. Поэтому целью нашего исследования было выявить возможные связи между микробиотой кала человека (как суррогатным маркером кишечной микробиоты) и депрессией.

Методы: Мы проанализировали образцы кала 55 человек: 37 пациентов и 18 контрольных участников без депрессии. Анализ основывался на данных глубокого секвенирования ампликонов гена 16S рРНК, полученных с помощью платформы Illumina.

Основные результаты: Мы выявили несколько корреляций между депрессией и микробиотой кала. Однако направление этих корреляций было противоположным даже у тесно родственных операционных таксономических единиц (OTU), хотя они по-прежнему были связаны с определенными филогенетическими группами более высокого порядка. Порядок Bacteroidales был представлен избыточно (p = 0,05), тогда как семейство Lachnospiraceae было представлено недостаточно (p = 0,02) среди OTU, ассоциированных с депрессией. На низких таксономических уровнях была одна клада, включавшая пять OTU в пределах рода Oscillibacter, и одна клада в пределах Alistipes, состоявшая из четырех OTU, которые значимо ассоциировались с депрессией (p = 0,03 и 0,01 соответственно).

Выводы и заключение: Типовой штамм Oscillibacter в качестве основного конечного продукта метаболизма образует валериановую кислоту, гомолог нейромедиатора ГАМК, а Alistipes ранее была связана с индуцированным стрессом у мышей. Таким образом, выявленные здесь таксономические корреляции могут соответствовать механистическим моделям.