Генетические варианты, повышающие риск смертности при COVID-19, выявлены на основе данных UK Biobank

Введение: Тяжесть коронавирусной болезни 2019 года (COVID-19), вызванной вирусом SARS-CoV-2, отличается значительной гетерогенностью. В исследованиях сообщалось, что у мужчин и представителей некоторых этнических групп риск смерти от COVID-19 выше, что позволяет предположить влияние генетических факторов хозяина на индивидуальный риск летального исхода.

Методы: В рамках этого проекта в качестве изучаемого признака рассматривали смертность и выполняли полногеномное исследование ассоциаций (GWAS) на данных 1778 инфицированных пациентов из UK Biobank (445 смертей, 25,03%). Традиционный GWAS не выявил в этой выборке ни одного генетического варианта с общегеномной значимостью. Чтобы повысить мощность GWAS и учесть возможные взаимодействия между несколькими локусами, для выявления генетических факторов использовали концепцию сверхварианта. Для проверки потенциальных ассоциаций применяли процедуру обнаружения и валидации.

Результаты: Были выявлены 8 сверхвариантов, которые стабильно определялись при многократных повторениях как локусы предрасположенности к смертности при COVID-19. Обнаруженные факторы риска в хромосомах 2, 6, 7, 8, 10, 16 и 17 содержали генетические варианты и гены, связанные с нарушением функции ресничек (DNAH7 и CLUAP1), сердечно-сосудистыми заболеваниями (DES и SPEG), тромбоэмболическими заболеваниями (STXBP5), митохондриальной дисфункцией (TOMM7) и врожденной иммунной системой (WSB1). Примечательно, что о гене DNAH7 недавно сообщалось как о наиболее подавленном после инфицирования эпителиальных клеток бронхов человека SARS-CoV-2.

Выводы: У пациентов белого британского происхождения были выявлены 8 генетических вариантов, значимо повышающих риск смертности при COVID-19. Эти данные могут дать своевременные ориентиры и потенциальные направления для лучшего понимания молекулярного патогенеза COVID-19 и генетической основы различной восприимчивости, что может повлиять на разработку новых терапевтических подходов.